Mercredi 21 Octobre 2020

Le coronavirus se propage rapidement dans le monde, selon une nouvelle analyse génétique


Des chercheurs britanniques ont examiné les mutations du virus et trouvé des preuves d'une propagation rapide, mais aucune preuve que le virus se transmet plus facilement ou risque de provoquer une maladie grave. "Le virus évolue, mais cela ne signifie pas en soi qu'il s'aggrave », a expliqué à CNN le chercheur en génétique François Balloux de l'Institut de génétique de l'University College de Londres. Balloux et ses collègues ont extrait des séquences virales d'une gigantesque base de données mondiale que les scientifiques du monde entier utilisent pour partager des données. Ils ont examiné des échantillons prélevés à différents moments et à différents endroits, et ont déclaré qu'ils indiquaient que le virus avait commencé à infecter des personnes à la fin de l'année dernière. "Cela exclut tout scénario qui suppose que SARSCoV-2 pourrait avoir été en circulation bien avant qu'il a été identifié, et a donc déjà infecté une grande partie de la population ", écrit l'équipe de Balloux dans son rapport, publié dans la revue Infection, Genetics and Evolution. C'est une mauvaise nouvelle. Certains médecins espéraient que le virus circulait depuis de nombreux mois et aurait pu discrètement infecter beaucoup plus de personnes que ce qui avait été signalé. Cela donnerait l'espoir qu'il pourrait y avoir une immunité déjà accumulée dans certaines populations. "Tout le monde espérait cela. Moi aussi", a déclaré Balloux. Leurs conclusions jettent de l'eau froide sur une telle idée. Au maximum, 10% de la population mondiale a été exposée au virus, a estimé Balloux.

Entre humains et chauves-souris

De nombreuses études différentes ont montré que le nouveau coronavirus, souvent appelé SARS-CoV-2 par les scientifiques, provenait d'une chauve-souris, mais devait infecter un autre animal avant de sauter chez l'homme. Les premiers cas humains ont été signalés à Wuhan, en Chine, en décembre dernier. Les virus font des erreurs à chaque fois qu'ils se reproduisent, et ces mutations peuvent être utilisées comme ce qu'on appelle une horloge moléculaire pour suivre un virus à travers le temps et la géographie. "Nos résultats sont en ligne avec des estimations précédentes et pointant vers toutes les séquences partageant un ancêtre commun vers la fin de 2019, soutenant cela comme la période où le SRAS-CoV-2 a sauté dans son hôte humain ", a écrit l'équipe." C'est très récent ", a déclaré Balloux. "Nous sommes vraiment, vraiment, vraiment convaincus que le saut de l'hôte s'est produit à la fin de l'année dernière." C'est parce que les échantillons viraux prélevés aux quatre coins du globe montrent de multiples mutations, et ce sont des mutations similaires. "Tout est partout", a écrit l'équipe. "Il a été introduit et introduit et introduit dans presque tous les pays", a ajouté Balloux. Ils ont également trouvé des preuves génétiques qui soutiennent les soupçons que le virus infectait des personnes en Europe, aux États-Unis et ailleurs depuis des semaines ou même des mois avant la notification des premiers cas officiels en janvier et février. Il sera impossible de trouver le "premier" patient dans aucun pays, a déclaré Balloux. "Toutes ces idées sur la recherche d'un patient zéro sont inutiles car il y a tellement de zéros de patients", a-t-il déclaré. Les résultats de l'équipe de Balloux ont été examinés par d'autres experts, un processus appelé examen par les pairs, avant leur publication dans la revue. Il a déclaré que certains rapports d'autres équipes, publiés en ligne sur ce que l'on appelle des sites Web préimprimés, peuvent avoir tiré des conclusions incorrectes. "Tous les virus mutent naturellement. Les mutations en elles-mêmes ne sont pas une mauvaise chose et rien ne suggère SARS-CoV-2 mutant plus rapidement ou plus lentement que prévu. Jusqu'à présent, nous ne pouvons pas dire si le SRAS-CoV-2 devient plus ou moins mortel et contagieux ", a déclaré Balloux. Lane Warmbrod est analyste au Johns Hopkins Center for Health Security qui a suivi rapports sur la génétique du nouveau coronavirus. Elle a déclaré que davantage d'études sont nécessaires chez les animaux pour démontrer comment les changements dans la génétique du virus pourraient le rendre plus ou moins infectieux ou pathogène. "Ce n'est pas parce que ces études nous disent que ces mutations se propagent rapidement ou deviennent dominantes que nous savons que cela s'est produit. Cela ne nous dit rien de ce qui se passe biologiquement", a déclaré Warmbrod à CNN. Les rapports sur les mutations peuvent être importants pour les équipes travaillant sur les médicaments et les vaccins pour lutter contre le coronavirus. Les vaccins, en particulier, doivent cibler les parties du virus qui sont conservées - qui ne changent pas beaucoup au fil du temps.

Le coronavirus se propage rapidement dans le monde, selon une nouvelle analyse génétique