Mardi 20 Octobre 2020

L'étude du coronavirus nécessite un laboratoire spécial de haute sécurité


Avant la pandémie, il n'y avait qu'un petit groupe de chercheurs dédiés à l'étude des coronavirus. Maintenant, cependant, les scientifiques du monde entier se concentrent sur le virus appelé SARS-CoV-2.
Il y a cependant un hic. Alors que les chercheurs peuvent étudier plus facilement la séquence génétique du virus ou l'épidémiologie de la pandémie, la conduite d'une série complète d'expériences avec le virus réel doit être effectuée dans des laboratoires certifiés de niveau de biosécurité 3 ou BSL-3.
Seules certaines installations ont ces laboratoires, qui ont besoin de systèmes de circulation d'air spéciaux et de deux ensembles de portes à fermeture automatique et verrouillables, ainsi que des inspections régulières. Il n'y a pas un seul organisme fédéral qui surveille le nombre de laboratoires BSL-3, bien qu'il y en ait au moins 200 aux États-Unis qui se soient inscrits auprès d'un programme gouvernemental qui suit certaines de ces recherches.
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Aux Gladstone Institutes de San Francisco, il se trouvait qu'il y avait une installation BSL-3 inutilisée, qui abritait autrefois les bactéries qui causent la tuberculose. L'organisation de recherche fait maintenant recertifier et autoriser le laboratoire par un comité de biosécurité de l'Université de Californie, auquel Gladstone est affilié. Il permettra à une équipe d'étudier le SRAS-CoV-2 sans avoir à se faufiler dans un autre laboratoire BSL-3 où les scientifiques travaillent déjà sur d'autres agents pathogènes.
«Nous ne pourrions pas construire un nouveau BSL-3 maintenant», a déclaré la virologue de Gladstone, Melanie Ott. «Cela prendrait des années. Parce que vous devez modifier la structure de la façon dont l'air circule, il doit être complètement séparé de tout le flux d'air dans le bâtiment et doit être spécifiquement filtré. »
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L'étude du coronavirus nécessite un laboratoire spécial de haute sécurité

STAT a récemment discuté avec Ott de l'installation et des besoins d'un laboratoire BSL-3. (Il existe un niveau encore plus sûr; les agents pathogènes BSL-4 incluent Ebola et Marburg.) Les membres de son équipe de recherche suivent également la formation requise pour travailler dans le laboratoire, qui devrait être opérationnel dans quelques semaines.
Ott a déclaré que l'étude des agents pathogènes BSL-3 supposait un certain risque - les chercheurs du laboratoire doivent porter un équipement de protection - mais étant donné la propagation du coronavirus, «je dirais que travailler dans ce laboratoire est probablement beaucoup plus sûr que d'aller au supermarché autour le coin."
Cette interview a été condensée et légèrement modifiée pour plus de clarté.
Pouvez-vous décrire l'espace où cela est redémarré? La chose que nous avons faite au cours des dernières semaines est de le recertifier et de faire toutes les bonnes inspections pour s'assurer que l'installation est testée de haut en bas. Cela implique le système des voies respiratoires, cela implique le système d'autoclave [a heating container that can sterilize equipment], cela implique les moniteurs à la porte qui montrent qui est dedans et qui est dehors. Cela implique juste beaucoup de pièces techniques. Mais en général, ce dont nous avions besoin était de nous assurer que ce que nous avions fonctionnait correctement et jusqu'à présent, je pense que cela semble assez bon.
Actuellement, nous l’équipons. Ce laboratoire était principalement utilisé comme laboratoire animalier. Nous en faisons maintenant une culture cellulaire et un laboratoire animalier. Donc, il a deux pièces essentiellement. Nous déplaçons actuellement des équipements du reste de l'institut vers le laboratoire, nous n'avons donc pas à attendre la livraison de nouveaux équipements.
Le véritable goulot d'étranglement est l'équipement de protection. Vous devez porter une combinaison Tyvek et un respirateur, et ceux-ci sont actuellement rares. Nous espérons obtenir cela dans les délais, mais on ne sait jamais de nos jours.
Un autre goulot d'étranglement est la formation. Vous devez suivre une formation rigoureuse pour entrer dans cette installation. Nous le faisons avec des collègues des autres installations BSL-3 de l'UC San Francisco qui nous aident vraiment généreusement, donc nous ne sommes pas en retard. Vous devez être formé, vous devez être certifié et vous devez vérifier que vous faites tout correctement.

J'imagine que si vous devez mettre tout cet équipement, vous allez dans ce laboratoire pendant un certain temps. Vous bloquez le temps, donc ce n'est pas comme si vous pouviez manquer d'un appel téléphonique ou quelque chose. Alors, êtes-vous là-bas seulement certains jours ou pour certaines périodes de temps? Tout prend le double du temps dans un laboratoire comme celui-ci. Et chaque fois que vous y allez, vous devez écrire un protocole et le faire approuver. Que faites-vous et comment le faites-vous? Comment vous débarrassez-vous des spécimens? Donc vous ne pouvez pas simplement dire, OK, maintenant j'ai ce laboratoire et maintenant je peux faire ce que je veux. Quels types de projets de recherche espérez-vous lancer une fois le laboratoire prêt? La seule chose que nous donne le BSL-3, c'est que nous pouvons travailler avec un virus vivant. Nous pouvons travailler pour voir si nous pouvons inhiber la propagation du virus dans les cellules en culture et étudier la cytopathicité du virus - comment il rend la cellule malade, en gros.
Nous avons également créé des organoïdes du tissu pulmonaire. Nous pensons que ceux-ci pourraient être utiles pour étudier ce virus. Vous n'êtes pas coronavirologue de fond. Quel genre de recherche faites-vous normalement? Je suis à l'origine neurologue, mais je suis passé à la virologie dans les années 90 pendant la crise du sida. J'étais à Francfort. C'était très similaire à maintenant - il n'y avait pas de traitements disponibles, de nombreuses personnes infectées et en phase terminale. J'ai donc décidé que je voulais approfondir le virus et en apprendre davantage et peut-être faire une différence.
J'ai continué à travailler sur les virus au cours des 30 dernières années, d'abord sur le VIH, puis sur l'hépatite C et le virus Zika au cours des dernières années.