Dimanche 25 Octobre 2020

Méfiez-vous des allégations exagérées de souches de coronavirus


Lire: Devriez-vous passer un test d'anticorps? "Nous avons des preuves pour une souche", dit Brian Wasik à l'Université Cornell "Je dirais qu'il n'y en a qu'un", dit Nathan Grubaugh à la Yale School of Medicine "Je pense que la majorité des gens en train d'étudier [coronavirus genetics] ne reconnaîtrait pas plus d'une souche en ce moment ", explique Charlotte Houldcroft à l'Université de Cambridge

Tout le monde pourrait être raisonnablement perplexe, étant donné que les reportages ont affirmé à plusieurs reprises qu'il y avait deux, trois, voire huit souches Il s'agit là encore d'un autre cas de confusion dans une crise qui semble criblée par eux Voici comment le comprendre

Méfiez-vous des allégations exagérées de souches de coronavirus

Chaque fois qu'un virus infecte un hôte, il se crée de nouvelles copies et commence par dupliquer ses gènes Mais ce processus est bâclé et les doublons se terminent par des erreurs Celles-ci sont appelées mutations - elles sont l'équivalent génétique des fautes de frappe

Dans les bandes dessinées et autres science-fiction, les mutations sont toujours dramatiques et conséquentes Dans le monde réel, ils font partie de la virologie normale et généralement banale Les virus accumulent naturellement et progressivement des mutations au fur et à mesure de leur propagation

Lire: Les meilleurs espoirs pour un médicament contre les coronavirus Au fur et à mesure que l'épidémie progresse, l'arbre généalogique des virus développe de nouvelles branches et rameaux - de nouvelles lignées caractérisées par des ensembles de mutations différents Mais une nouvelle lignée ne compte pas automatiquement comme une nouvelle souche Ce terme est généralement réservé à une lignée qui diffère de ses collègues virus de manière significative

Elle peut varier dans sa facilité de propagation (transmissibilité), sa capacité à provoquer des maladies (virulence), si elle est reconnue par le système immunitaire de la même manière (antigénicité), ou sa vulnérabilité aux médicaments (résistance) Certaines mutations affectent ces propriétés La plupart ne le font pas et sont soit silencieux, soit cosmétiques

«Toutes les mutations ne créent pas une souche différente», explique Grubaugh (Considérez les races de chiens comme des équivalents de souches: un corgi est clairement différent d'un grand danois, mais un corgi aux cheveux noirs est fonctionnellement le même qu'un chien aux cheveux bruns et ne compterait pas comme une race distincte) Il n'y a pas seuil clair et fixe pour quand une lignée compte soudainement comme une souche

Mais le terme a la même connotation en virologie que familièrement - il implique une importance Les virus changent tout le temps; des tensions surviennent lorsqu'elles changent de manière significative De nouvelles souches de grippe apparaissent chaque année

Ces virus acquièrent rapidement des mutations qui modifient la forme des protéines à leur surface, les rendant invisibles aux mêmes cellules immunitaires qui auraient reconnu et attaqué leurs ancêtres Ce sont des changements clairement significatifs - et ils expliquent en partie pourquoi le vaccin contre la grippe doit être mis à jour chaque annéeLire: Pourquoi certaines personnes deviennent plus malades que d'autresMais la grippe est connue pour muter rapidement

Les coronavirus - qui, pour être clairs, appartiennent à une famille complètement distincte des virus de la grippe - évoluent au dixième de la vitesse Le nouveau, SARS-CoV-2, ne fait pas exception "Il n'y a rien d'extraordinaire ici", explique Grubaugh

Oui, le virus a détecté plusieurs mutations depuis qu'il a fait son apparition chez l'homme à la fin de 2019, mais pas plus que ne l'avaient prédit les scientifiques Oui, son arbre généalogique s'est ramifié en différentes lignées, mais aucune ne semble matériellement différente des autres «Il s'agit encore d'une épidémie si jeune que, compte tenu du faible taux de mutation, il serait surprenant de voir quoi que ce soit si tôt», déclare Houldcroft