Mardi 24 Novembre 2020

Un professeur du MIT traduit le son des séquences complexes du coronavirus


Erin Blakemore, The Washington Post
    Publié
        
            14 h 41 HAC, samedi 11 avril 2020

  • Markus Buehler conçoit de nouvelles protéines à l'aide de l'intelligence artificielle. Il a récemment traduit la protéine de pointe du nouveau coronavirus en son pour visualiser ses propriétés vibratoires, comme on le voit ici. Les couleurs primaires représentent les trois chaînes protéiques du pic. Moins
                                Markus Buehler conçoit de nouvelles protéines à l'aide de l'intelligence artificielle. Il a récemment traduit la protéine de pointe du nouveau coronavirus en son pour visualiser ses propriétés vibratoires, comme on le voit ici. ... plus
                                                                                                                                                                
        

    Un professeur du MIT traduit le son des séquences complexes du coronavirus

                
                                                                                                                                Photo: gracieuseté de Markus Buehler

  • Photo: gracieuseté de Markus Buehler
                                                        
                                        
        

                            

                
                    
                    
                                                
                                                                                                                                                                                                                                                        Markus Buehler conçoit de nouvelles protéines à l'aide de l'intelligence artificielle. Il a récemment traduit la protéine de pointe du nouveau coronavirus en son pour visualiser ses propriétés vibratoires, comme on le voit ici. Les couleurs primaires représentent les trois chaînes protéiques du pic. Moins
                                Markus Buehler conçoit de nouvelles protéines à l'aide de l'intelligence artificielle. Il a récemment traduit la protéine de pointe du nouveau coronavirus en son pour visualiser ses propriétés vibratoires, comme on le voit ici. ... plus
                                                                                                                                                                
        

                                                                                                                                Photo: gracieuseté de Markus Buehler
                                                        
                                        
        

                                        
                
                

        
            
                
                    
                    Un professeur du MIT traduit le son des séquences complexes du coronavirus
                    
                    
                    
                
            
        

                                        
                                    
                Contrepoint viral de la protéine de pointe du coronavirus

        
                Les coronavirus tirent leur nom de la couronne de protéines spikelike qui les entourent. Maintenant, les pics protéiques du nouveau coronavirus ont été transformés en une composition musicale intrigante - un chercheur espère pouvoir inspirer de nouvelles façons de lutter contre le virus.

        
                Les protéines de pointe ont une fonction puissante pour le nouveau coronavirus. Ils lui permettent de se fixer aux cellules humaines, puis de les détourner pour que le virus puisse se répliquer.

        
                                    

                
                Considérez les protéines de pointe comme des clés spéciales à la recherche d'un verrou humain. Dans le cas du nouveau coronavirus, officiellement appelé SARS-CoV-2, la protéine de pointe se lie aux protéines réceptrices des cellules humaines appelées enzyme de conversion de l'angiotensine 2.

        
                                                
                        
                Alors que tous les coronavirus dépendent des protéines de pointe pour se fixer aux cellules humaines, la protéine de pointe de SARS-CoV-2 est particulièrement bonne dans ce domaine. Des chercheurs de l'Université du Minnesota ont récemment découvert que la protéine de pointe du SARS-CoV-2 possède des attributs qui la rendent attachée au moins 10 fois plus fermement aux protéines des récepteurs humains que les autres coronavirus.

        
                                    
                        
                
                                    

                
                La protéine de pointe de SARS-CoV-2 se compose de trois chaînes délicatement repliées d'acides aminés. Markus Buehler, musicien et professeur d'ingénierie au Massachusetts Institute of Technology, a transformé cette structure complexe en un morceau de musique.

        
                                    
                        
                
                Buehler et ses collègues ont récemment inventé un moyen de traduire des séquences d'acides aminés comme celles qui composent SARS-CoV-2 en son en utilisant la séquence génétique du virus et un algorithme qui traduit ses acides aminés et leurs structures et vibrations moléculaires en son.

        
                                    
                        
                
                Comportant le koto, les cloches, les flûtes et d'autres instruments, la composition de près de deux heures est trompeusement pacifique - un peu comme le virus lui-même.

        
                La musique "ne transmet pas vraiment les effets mortels que cette protéine particulière a sur le monde", écrit Buehler. "La musique est une métaphore de [the virus' ability] pour tromper l'hôte et l'exploiter pour sa propre multiplication. "

        
                Peut-être que cela pourrait également inspirer un moyen d'empêcher la protéine d'envahir les cellules humaines - et pas de la façon dont vous pourriez le penser. Buehler et ses collègues pensent que la musique générée par des protéines pourrait être utilisée comme un moyen alternatif de visualiser la complexité des protéines et éventuellement trouver des endroits à cibler avec des médicaments.