Mardi 27 Octobre 2020

Tests de coronavirus : pourquoi les trois principaux types de tests ne peuvent pas être facilement produits en masse


L'un reste douteusement fiable et n'est utile qu'après coup, et l'autre en est encore au début du développement, mais pourrait accélérer et simplifier les résultats.Voici un aperçu de chacun des trois principaux tests, de leurs forces et de leurs faiblesses, et des blocages qui ont ralenti leur production de masse rapide.

Tests PCR

Que sont-ils?Les tests de réaction en chaîne par polymérase, appelés PCR, sont les tests les plus courants et les plus précis pour déterminer si une personne est actuellement infectée par le nouveau coronavirus. Comment travaillent-ils? Chaque virus a un code génétique unique. Le nouveau test PCR de coronavirus fonctionne en commençant par un écouvillon de gorge ou un échantillon d'expectoration d'un patient, en amplifiant cet échantillon dans une machine, puis en recherchant du matériel génétique de coronavirus unique. D'abord, un travailleur de la santé prend un échantillon d'écouvillon ou d'expectoration par l'arrière de la gorge ou du nez du patient, généralement à l'aide d'un écouvillon nasopharyngé long et mince. Cet écouvillon est stocké dans un tube ou un flacon stérile et est ensuite envoyé à un laboratoire qui a accès à un kit de test. Là, des techniciens de laboratoire formés extraient toute information génétique de l'échantillon. Le matériel génétique purifié est ensuite mélangé à des matériaux, y compris certains dérivés du coronavirus lui-même, qui sont appelés réactifs. La solution entière est ensuite placée dans une machine de test de la taille d'un grille-pain. Si l'échantillon d'un patient contient un coronavirus, le matériel génétique du virus sera amplifié et la machine retournera un résultat positif. Et si le spécimen n'a pas de coronavirus, il y aura un résultat négatif. L'ensemble du processus peut généralement être mesuré en jours, bien que le temps nécessaire pour obtenir un résultat soit plus court si les hôpitaux ou les cliniques ont des kits de test en interne.Pourquoi ce test est-il important?Le test PCR est le test de diagnostic le plus répandu et le plus précis pour déterminer si une personne est actuellement infectée par un coronavirus. Aux États-Unis, près d'un million de personnes ont été testées positives pour le coronavirus à l'aide de ce test de PCR.Les responsables de la santé ont toujours déclaré que des tests étaient nécessaires pour comprendre où le virus se propage - et comment l'arrêter.Les personnes qui se sont révélées positives pour le virus peut se mettre en quarantaine et s'isoler et l'empêcher de se propager aux autres. Ceci est particulièrement important avec Covid-19 car certaines personnes infectées ne présentent aucun symptôme et, sans test positif, ne savent même pas qu'elles propagent le virus.Quels sont les hold-up?Premièrement, le déploiement initial par le Centers for Disease Control and Prevention du test PCR était lourd de problèmes qui ont retardé la réponse rapide des États-Unis. Ce problème a depuis été corrigé mais a entraîné un retard dans les tests dès le début.Maintenant, le blocage principal est simplement une question d'offre et de demande.Le test PCR nécessite des fournitures spécialisées, des instruments coûteux et l'expertise de techniciens de laboratoire qualifiés. En raison de la demande soudaine de masse pour ces tests et des problèmes correspondants dans la chaîne d'approvisionnement, il y a eu des pénuries à presque toutes les étapes du processus, y compris des tampons et des réactifs. "Nous voulons tous toutes ces choses", a déclaré le Dr April Abbott, le directeur de la microbiologie pour Deaconess Health System dans l'Indiana. «Le simple fait de gérer cela a été une lutte extrême.» Abbott a déclaré qu'au fil du temps, il était plus facile pour son système hospitalier d'obtenir des tampons et des réactifs. Dans l'ensemble, cependant, le test PCR nécessite une expertise et des fournitures spécialisées d'une manière qui rend difficile l'augmentation de la production si immédiatement, d'autant plus que le gouvernement fédéral a poussé la responsabilité sur les États individuels. "Cela revient à un gros problème logistique", a déclaré Dr Donald Thea, professeur de santé mondiale à l'Université de Boston. «Les gros problèmes logistiques sont mieux traités par les organisations habituées à gérer les gros problèmes logistiques», comme le gouvernement fédéral.

Tests de coronavirus : pourquoi les trois principaux types de tests ne peuvent pas être facilement produits en masse

Tests d'anticorps

Que sont-ils? Les tests d'anticorps, également appelés tests sérologiques, ne détectent pas le virus lui-même. Au lieu de cela, ils détectent si quelqu'un a des anticorps dans son système immunitaire pour combattre le nouveau coronavirus. Les gens développent des anticorps lorsque leur corps combat le virus.Comment travaillent-ils?Des tests d'anticorps sont effectués sur un échantillon de sang. Cela peut provenir d'une piqûre au doigt ou d'une veine. La majorité des tests d'anticorps nécessitent ensuite un expert qualifié pour examiner cet échantillon de sang à la recherche d'anticorps spécifiquement ciblés contre le coronavirus.Notre circulation sanguine possède une bibliothèque d'anticorps contre diverses infections virales, bactériennes et fongiques que nous avons eues au cours de notre vie, a déclaré CNN Medical Analyst. Dr Kent Sepkowitz, spécialiste des maladies infectieuses. Le but de ce test est de trouver l'anticorps qui s'applique spécifiquement au nouveau coronavirus qui cause Covid-19.Cependant, il existe sept coronavirus différents qui causent des maladies chez l'homme, dont plusieurs provoquent des symptômes bénins comme le rhume. Nos anticorps pour chaque coronavirus semblent similaires, donc déchiffrer entre l'anticorps contre le rhume et l'anticorps Covid-19 est un véritable défi scientifiquement, a déclaré Sepkowitz.Pourquoi ce test est-il important?Les tests d'anticorps ne sont généralement pas utilisés pour le diagnostic, mais pour donner une idée de l'étendue de la propagation du virus dans une population. Étant donné que les tests PCR étaient rares dans les premières semaines de l'épidémie de coronavirus, des tests d'anticorps plus larges nous aideraient à savoir combien de personnes se sont rétablies du coronavirus, peut-être même sans savoir qu'elles étaient infectées.En outre, la plupart des experts pensent que les personnes qui se sont rétablies contre le virus aura une sorte de protection contre la réinfection, de sorte que les tests d'anticorps pourraient être utilisés pour décider qui est immunisé contre le virus et qui peut être en mesure de retourner au travail sans crainte d'infection. Cependant, parce que le virus est encore si nouveau, on ne sait pas à quel point cette immunité pourrait être forte ou combien de temps elle pourrait durer. "Nous nous attendons à ce que la plupart des personnes infectées par # COVID19 développent une réponse en anticorps qui fournira un certain niveau de protection", a écrit samedi l'Organisation mondiale de la santé dans une série de tweets. "Ce que nous ne savons pas encore, c'est le niveau de protection ou combien de temps cela durera. Nous travaillons avec des scientifiques du monde entier pour mieux comprendre la réponse du corps à l'infection # COVID19. Jusqu'à présent, aucune étude n'a répondu à ces questions importantes. "Quels sont les hold-up?Le principal problème avec les tests d'anticorps est la question de la précision. On ne sait pas encore si ces tests sont toujours corrects.En mars, la Food and Drug Administration a publié une politique permettant aux développeurs de tests d'anticorps d'aller sur le marché sans examen préalable de la FDA s'ils remplissaient certaines conditions. La FDA a également autorisé huit tests d'anticorps dans le cadre d'une autorisation d'utilisation d'urgence, ce qui signifie que la FDA n'a pas validé l'exactitude des tests. Cela a conduit à une surabondance de tests non fiables et à l'incertitude parmi les responsables de la santé chargés de les obtenir. "Ce niveau rigoureux d'étude n'a tout simplement pas eu lieu avec la majorité des tests d'anticorps qui sont disponibles ", a déclaré Abbott. Des résultats inexacts pourraient également avoir des conséquences mortelles. Un faux positif sur un test d'anticorps pourrait conduire quelqu'un à penser qu'il est immunisé contre le virus, ce qui pourrait être plus dangereux que pas de résultat du tout. "Nous ne voulons vraiment pas acheter quelque chose qui pourrait donner des informations inexactes", a déclaré Abbott. "Il serait pire de donner des résultats qui seraient inexacts. Nous voulons nous assurer que nous sommes très confiants dans les résultats que nous donnons."

Tests d'antigène

Que sont-ils?Les tests d'antigène sont un moyen rapide et facile de rechercher un antigène spécifique - un terme pour toute substance étrangère, comme un virus ou une bactérie. Les tests d'antigène pour la grippe ou l'angine streptococcique, par exemple, peuvent être effectués dans un cabinet de médecin sans équipement coûteux et donner des résultats en quelques minutes.Il n'y a pas encore de test d'antigène fiable pour le nouveau coronavirus, mais il est théoriquement possible et les entreprises travaillent à faire un.Comment travaillent-ils? Pensez à un test de grossesse à domicile. Dans un test d'antigène de coronavirus, vous placez un échantillon corporel tel qu'un tampon de gorge sur une bandelette spécialement traitée, qui utilise ensuite une couleur ou un marqueur pour dire si le nouveau coronavirus est présent. Le test de l'antigène fonctionne en recherchant une partie unique du nouveau coronavirus, comme une protéine spécifique sur l'un de ses pointes "corona". Si cette protéine spécifique est présente en quantités détectables, le test renvoie un résultat positif.Pourquoi ce test est-il important?Les tests d'antigènes pourraient fournir des réponses immédiates pour savoir si une personne est infectée par un coronavirus et pourraient en théorie être produits en masse pour un usage domestique.Ces tests ne remplaceraient probablement pas les tests PCR, qui sont les plus fiables, mais ce serait une bonne première étape. L'OMS a déclaré que ces "pourraient potentiellement être utilisés comme des tests de triage pour identifier rapidement les patients qui sont très susceptibles d'avoir COVID-19, réduisant ou éliminant le besoin de tests de confirmation moléculaires coûteux." Dr. Deborah Birx, la coordinatrice de la réponse aux coronavirus de la Maison Blanche, a déclaré que les États-Unis auront besoin d'une percée dans les tests d'antigènes pour augmenter les tests à des niveaux suffisants. "Il n'y aura jamais la possibilité sur un test d'acide nucléique de faire 300 millions de tests par jour ou de tester tout le monde avant d'aller au travail ou à l'école ", a déclaré Birx au début du mois. "Mais il pourrait y en avoir avec le test d'antigène."Quels sont les hold-up?Jusqu'à présent, les tests d'antigène pour le coronavirus ne fonctionnent pas de manière cohérente. Sur la base de tests antigéniques similaires pour les maladies respiratoires comme la grippe, leur sensibilité - la capacité à identifier correctement les patients atteints de Covid-19 - varie entre 34% et 80%, selon l'OMS. "Sur la base de ces informations, la moitié ou plus de Selon Gigi Gronvall, chercheur principal au Johns Hopkins Center for Health Security, les patients infectés par COVID-19 pourraient ne pas être atteints par de tels tests, "selon l'agence." Parfois, les virus peuvent avoir des plis spéciaux ou des modifications des protéines à leur surface, ce qui peut interférer avec le processus ", a déclaré Gronvall. En outre, alors que les tests de PCR amplifient le matériel génétique du virus pour détecter même de petites quantités, les tests d'antigène peuvent nécessiter une plus grande quantité de virus. "Et puis, en plus de la partie conception, vous devez avoir suffisamment de virus en vous pour tester positif ", a-t-elle ajouté. En raison de ces problèmes scientifiques en cours, le test d'antigène est prometteur mais reste à quelques pas, selon Sepkowitz." En ce moment, c'est de la tarte dans le ciel ", a-t-il déclaré. Mallory Simon et Gina Yu de CNN ont contribué à ce rapport.