Vendredi 30 Octobre 2020

Le visualiseur de mutation de coronavirus en ligne donne des indices sur la propagation du coronavirus à travers le monde


CLEVELAND, Ohio - Un nouveau visualiseur en ligne peut cartographier les mutations du coronavirus, dessinant un «arbre généalogique» qui peut donner des indices aux épidémiologistes et aux chercheurs sur la façon dont le virus s'est propagé et a changé à travers le monde Bien que le virus soit originaire de Wuhan, en Chine, Nextstrain org montre à quel point le SRAS-CoV-2 a changé au cours de ses déplacements en Asie et en Europe

Une analyse de 25 séquences de l'Ohio, tirées d'une base de données nationale de mutations du génome, montre que la majorité provenait d'une mutation survenue en Europe C’est également vrai à New York, selon un rapport du New York Times, mais pas de manière générale sur la côte ouest Le visualiseur utilise un nombre limité de séquences et ne montre pas exactement comment certaines mutations se propagent d'une ville à l'autre

Le visualiseur de mutation de coronavirus en ligne donne des indices sur la propagation du coronavirus à travers le monde

Ces informations peuvent être obtenues par une plongée plus profonde si une ville a une mutation prédominante et unique, et vous pouvez alors voir cette propagation dans d'autres villes, a déclaré Angelo DeLucia, professeur agrégé de virologie moléculaire et de biologie du cancer à l'Université médicale du nord-est de l'Ohio, ce qui pourrait - théoriquement - être utile dans la réglementation des voyages sur le taux de mutation du virus On pense que le virus du SRAS-CoV-2 est assez stable, mais comme le virus est nouveau, les chercheurs s'efforcent de déterminer à quel point sa structure change au fil du temps

Il n'y a actuellement aucun médicament ou vaccin antiviral approuvé pour le SRAS- CoV-2 Des modifications importantes de la pointe du virus pourraient rendre un vaccin moins efficace Ces données donnent également des indices sur le taux de recombinaison, a déclaré DeLucia

La recombinaison fait référence à la façon dont le virus est capable de corriger des erreurs dans son code génétique qui pourraient perturber sa capacité à se répliquer Les antiviraux provoquent ces erreurs, donc en suivant les taux de recombinaison, les développeurs peuvent également les utiliser pour informer les traitements antivirauxLe visualiseur NextStrain, qui est en cours de mise à jour, est exploité par une équipe de chercheurs

Il s'agit d'un projet open source, ce qui signifie que ceux qui l'utilisent ont accès à la méthodologie et au codage derrière le visualiseur