Mardi 11 Aout 2020

Des études sanguines nationales sans précédent cherchent à suivre la propagation du coronavirus aux États-Unis | Science


Les chercheurs espèrent mieux comprendre le pourcentage d'Américains qui ont été infectés par le nouveau coronavirus en pêchant avec du sang donné.
  
          
                          
            
  
      Photographie scientifique / Science Source
          
              
    
  
  
    
          
  Par Jon CohenApr. 7, 2020, 4:05 PM
Les rapports COVID-19 de Science sont pris en charge par le Pulitzer Center.
Nous ne savons toujours pas combien de personnes ont été infectées par le nouveau coronavirus, le SRAS-CoV-2. Non seulement les pays ont eu du mal à déployer des tests à grande échelle pour le virus, mais ces efforts manqueront inévitablement aux personnes qui se sont remises d'une infection. La meilleure façon de déterminer dans quelle mesure le virus s'est propagé dans une population est d'examiner le sang. Les anticorps, protéines sanguines que le système immunitaire produit pour attaquer les agents pathogènes, sont des empreintes digitales virales qui restent longtemps après l'élimination des infections. Les tests sensibles peuvent les détecter même chez les personnes qui n'ont jamais ressenti un seul symptôme de COVID-19.

L'Organisation mondiale de la santé a annoncé un effort mondial ambitieux, appelé Solidarité II, de soi-disant enquêtes sérologiques, des études qui recherchent des anticorps contre le SRAS-CoV-2 dans la population.

Des études sanguines nationales sans précédent cherchent à suivre la propagation du coronavirus aux États-Unis | Science

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  • Les États-Unis ont également lancé un effort sans précédent. Une enquête sérologique est déjà en cours dans six régions métropolitaines, dont New York, la ville la plus touchée des États-Unis. Un deuxième, encore plus grand, est sur ses talons, et ensemble, ils devraient déployer de grands efforts à l'échelle nationale pour suivre de près le nombre d'Américains infectés au fur et à mesure que la pandémie se déroule. Les enquêtes sérologiques peuvent également contribuer aux efforts de développement de vaccins et, séparément, tenter de concevoir des thérapies pour empêcher le virus de causer des dommages.

    La science a parlé à Michael Busch, un spécialiste de la transfusion basé à l'Université de Californie à San Francisco (UCSF), qui est l'un des chefs de file de ces efforts. Busch a étudié les infections sanguines humaines causées par tous les virus imaginables. Il dirige le Vitalant Research Institute, un organisme sans but lucratif lié à 170 centres de don de sang dans le pays et reconnu mondialement pour ses études sur les maladies infectieuses.

    Cette interview avait été modifiée pour plus de clarté et de longueur.
    Q: Quelle est votre vue d'ensemble des enquêtes sérologiques? UNE: Il existe toute une gamme de «cas d'utilisation» pour les tests sérologiques. Vous pouvez utiliser la sérologie en complément des tests sur écouvillon qui détectent le virus pour aider à diagnostiquer les infections aiguës. Il peut identifier les donneurs de plasma de patients récupérés qui peuvent être transfusés à des patients COVID-19 comme traitement potentiel. Cela peut aider à estimer le moment de l'infection. Et pour les vaccins, nous devons disposer d'outils sérologiques capables de faire la distinction entre les anticorps induits par le vaccin et l'infection naturelle.
    Q: Peu de temps après que la transmission se soit produite et que les gens soient gravement infectés, vous n’allez pas avoir d’anticorps, n’est-ce pas? UNE: La proportion de personnes ayant récemment acquis le SRAS-CoV-2 qui seraient positives avec un seul point dans le temps avec un écouvillonnage pharyngé nasal - l'échantillon de diagnostic habituel, qui utilise la réaction en chaîne de la polymérase pour amplifier de minuscules morceaux d'acide nucléique viral afin qu'il puisse être détecté - est probablement de 50%, ou au mieux de 70% à 80%. Les tests d'anticorps ne détecteraient pas les personnes aux premiers stades de l'infection qui avaient des infections asymptomatiques, mais les données deviennent très solides que dans les 4 à 5 jours suivant le début de la maladie, les anticorps sont détectables. Donc, si vous voulez vraiment détecter des infections aiguës, vous devez ajouter une sérologie aux tests d'acides nucléiques.
    Q: Quelles enquêtes sérologiques faites-vous aux États-Unis? UNE: Nous développons trois grandes études sérologiques. Nous devons les faire à intervalles réguliers pour détecter l'incidence continue, pour déterminer si les réponses en anticorps diminuent et pour évaluer l'immunité du troupeau.

    La première, qui sera financée par les National Institutes of Health, est déjà en cours dans six régions métropolitaines des États-Unis.Elle a commencé à Seattle lorsque cette épidémie s'est produite, puis à New York, puis nous avons rapidement lancé dans la baie de San Francisco., et maintenant nous avons ajouté Los Angeles, Boston et Minneapolis. Les collègues des centres de transfusion sanguine régionaux enregistrent chacun 1 000 échantillons de donneurs chaque mois - souvent c'est juste quelques jours par mois - et ils sont définis démographiquement afin que nous connaissions l'âge, le sexe et, plus important encore, le code postal du donneur résidence. Ces 6000 échantillons, collectés chaque mois à partir de mars et pour les 5 prochains mois, seront évalués avec un algorithme de test d'anticorps, que nous sommes encore en train de finaliser, qui nous aidera à surveiller combien de personnes développent des anticorps SARS-CoV-2 au fil du temps . Cela nous montrera lorsque nous passerons, disons, d'un demi-pour cent à 2% des donneurs ayant des anticorps.

    Cela deviendra une enquête nationale. Avec le soutien des Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis [CDC], nous effectuerons trois enquêtes sérologiques nationales entièrement représentatives de la population américaine à l'aide des donneurs de sang. Il s'agira de 50 000 dons en septembre et décembre 2020 et novembre 2021. Nous allons estimer la prévalence globale des anticorps anti-SRAS-CoV-2 dans chaque État, mais aussi la cartographier dans les États pour les régions et les zones urbaines métropolitaines et regardez les différences.
    Q: Est-ce la plus grande enquête sérologique prévue aux États-Unis actuellement? UNE: À ma connaissance, oui. C'est certainement la plus grande enquête sérologique à laquelle j'ai jamais participé.
    Q: Quelle est la troisième enquête sérologique que vous faites? UNE: Nous voulons comparer les résultats que nous obtenons de nos enquêtes sérologiques auprès de donneurs de sang dans plusieurs régions géographiques avec des collègues qui effectuent différents types d'enquêtes sur les populations. Nous collaborons étroitement avec des collègues de l'UCSF et de l'Université de Washington, et ils effectuent des enquêtes sérologiques auprès des populations en frappant à la porte du quartier et en capturant des échantillons du laboratoire d'hématologie.
      
      
      
      
          
        
          
                      
                
      
          Michael Bush, directeur du Vitalant Research Institute, participe à la réalisation de vastes enquêtes sérologiques sur les coronavirus aux États-Unis.
      
              
                              
                
      
          Michael P. Busch

    Q: Quand pensez-vous avoir vos premières données de surveillance qui pourront répondre aux grandes questions sur le pourcentage de la population asymptomatique ou présymptomatique? UNE: Je ne peux pas divulguer les données, mais nous avons des résultats pour Seattle pour mars, et nous aurons des résultats la semaine prochaine pour New York pour la dernière semaine de mars.
    Q: Pourquoi ne dévoilez-vous pas vos données la semaine prochaine? UNE: Nous sommes prudents car les donneurs de sang ne sont pas un échantillon représentatif. Ce sont des personnes asymptomatiques et afébriles [without a fever]. Nous avons un «effet donneur sain». Les données d'incidence basées sur les donneurs pourraient être inférieures d'un mois ou deux à l'incidence de la population en raison de ce biais.
    Q: Les personnes infectées n'ont souvent pas de SARS-CoV-2 détectable dans leur sang, et jusqu'à présent, seul l'acide nucléique viral - pas un virus infectieux - a été trouvé et aucun cas de transmission liée à la transfusion n'a été signalé. La contamination par le SRAS-CoV-2 de l'approvisionnement en sang est-elle préoccupante? UNE: À ce stade, c'est théorique, et la Food and Drug Administration recommande de ne pas dépister les donneurs de sang ou de tissus avec des tests de laboratoire pour l'ARN du SRAS-CoV-2. La FDA est très préoccupée par le fait qu'il n'y a pas de réaction excessive au risque pour la sécurité transfusionnelle. Et je suis d'accord avec eux. Mais il est assez inquiétant que nous menions des études à très grande échelle pour enquêter sur le taux de détection des acides nucléiques viraux chez les donneurs, ainsi que des études sur le potentiel de transmission transfusionnelle dans des modèles animaux, y compris les macaques et les souris humanisées.
    Q: Il existe différents types d'anticorps que le système immunitaire produit à différents moments après l'apparition d'une infection. Les tests d'anticorps peuvent-ils agir comme des horloges et révéler quand quelqu'un a été infecté? UNE: Avec un seul échantillon d'un patient, vous pouvez distinguer les personnes qui ont été infectées pendant 1 ou 2 semaines à mesure que leur réponse immunitaire arrive à maturité, par rapport à des périodes plus longues après l'infection. Il existe de nombreuses façons de procéder: il existe tout un domaine qui a évolué pour détecter de nouvelles infections par le VIH et les virus de l'hépatite B et C. Ces tests ne seraient pas très efficaces pour discriminer les infections survenues il y a 3 ou 4 jours par rapport à il y a une semaine, mais une fois que vous êtes sorti 4 à 6 ou 10 semaines après l'infection, l'augmentation de l'intensité du signal et le schéma d'anticorps vous permettent d'imputer la date estimée de l'infection avec une bonne précision.
    Q: Pourquoi est-ce important que quelqu'un ait été infecté il y a 1 semaine ou 1 mois? UNE: Rencontrer des personnes infectées est important. Lorsque nous entrerons en été, en automne et en hiver, nous voudrons distinguer si les gens ont été infectés au cours de cette période d'épidémie précoce. Vous voulez savoir s'il s'agit d'une infection saisonnière actuelle ou d'anticorps de la dernière saison épidémique. C'était le cas de Zika. Lorsqu'une femme était enceinte et testée positive aux anticorps, vous vouliez lui dire s'il s'agissait d'une infection acquise au cours de cette grossesse - ce qui signifiait que son bébé était à risque de microcéphalie - ou si elle avait été infectée avant la grossesse en cours.

    Nous sommes également préoccupés par les coronavirus apparentés qui causent le rhume chez les humains. Ces virus induisent des réponses en anticorps qui, au moins temporairement, «neutralisent» le virus, mais ils ne semblent pas durer. Parce que les anticorps neutralisants diminuent au cours de 1 à 2 ans, les gens peuvent être réinfectés avec exactement le même coronavirus 1 ou 2 ans plus tard. L'idée simpliste est que les gens vont être infectés par le SRAS-CoV-2 et ensuite ils seront résistants à l'infection pour le reste de leur vie, et que l'immunité du troupeau s'accumulera avec le temps, etc. Mais si c'est quelque chose comme les coronavirus les plus traditionnels qui provoquent des rhumes communs, vous obtiendrez une activité neutralisante robuste au début, mais elle diminuera avec le temps. Et donc nos études sont vraiment axées sur l'évaluation de cette question de la persistance de l'immunité contre la réinfection.
    Q: Quelles sont les implications d'une diminution de l'immunité? UNE: Tous ces efforts actuels pour dépister tout le monde et leur dire: «Oh, vous êtes à l'abri d'une infection future», cela peut être vrai pour l'instant, mais ce ne sera peut-être pas le cas dans un an ou deux. Cela affecte également la collecte de plasma de donneurs récemment récupérés pour transfusion aux patients. Dans un an, leurs anticorps pourraient décliner. Vous pourriez potentiellement utiliser les vaccins contre le SRAS-CoV-2 pour renforcer leur immunité et aussi pour récolter leurs anticorps neutralisants comme thérapeutique ou pour la prophylaxie.
    Q: Que se passe-t-il lorsque le SRAS-CoV-2 infecte une personne qui a des anticorps contre les quatre autres coronavirus qui infectent les humains et provoquent le rhume? UNE: Nous étions en communication aujourd'hui avec le CDC à ce sujet. Si nous regardons les personnes qui viennent de subir une infection par le SRAS-CoV-2 et qui ont une explosion d’anticorps contre le virus, elles ont également renforcé leurs anticorps préexistants contre le coronavirus froid classique. Et les premières réponses en anticorps que les chercheurs du CDC ont vues dans des études longitudinales minutieuses sur le SRAS-CoV-2 sont en fait ces réponses mémoires croisées aux coronavirus froids classiques.
    Q:Comment ces réponses d'anticorps croisés peuvent-elles être importantes? UNE: La mémoire immunitaire des infections précédentes peut aider à contrôler l'infection par ces virus du rhume et même à atténuer les symptômes de l'infection par le SRAS-CoV-2. Mais cela peut entraîner des problèmes avec la précision des diagnostics du SRAS-CoV-2, car les personnes réinfectées avec des coronavirus froids communs pourraient donner un résultat faussement positif avec certains tests sérologiques SARS-CoV-2.