Dimanche 20 Septembre 2020

Des scientifiques découvrent une mutation unique du nouveau coronavirus


Les chercheurs ont identifié une mutation dans le code génétique du SRAS-CoV-2 qui reflète les changements observés par les scientifiques lors de l'épidémie de SRAS de 2003. Partager sur Pinterest Une mutation récemment découverte dans le SRAS-CoV-2 éclaire la façon dont l'épidémie actuelle pourrait évoluer. -CoV-2 est le virus qui cause la maladie COVID-19. Dans la mutation, 81 lettres du génome du virus ont été supprimées. Les mutations virales font partie intégrante de l'évolution d'un virus et peuvent altérer la gravité de la maladie qu'elles provoquent. Dans le cas du SRAS-CoV-2, la découverte est intéressante car la nature de la mutation suggère qu'elle peut avoir une association avec une forme moins sévère de la maladie. Un virus moins virulent peut avoir un avantage sélectif sur d'autres souches.La recherche, menée par une équipe de scientifiques de l'Arizona State University (ASU), aux États-Unis, est maintenant un article de correspondance dans le Journal of Virology.Bien que certains chercheurs se soient concentrés sur le suivi du nombre de cas de COVID-19 par rapport à la la propagation mondiale du SRAS-CoV-2, d'autres suivent le virus au fur et à mesure qu'il commence à muter, créant des changements dans son code génétique qui peuvent affecter son fonctionnement. Des mutations se produisent lorsqu'un changement de matériel génétique s'intègre dans le génome viral et se transmet à la génération suivante. Dans le cas des virus, une génération est généralement le cycle d'infection d'une cellule particulière. L'équipe de l'ASU effectuait à l'origine des recherches sur les virus de la grippe, analysant les échantillons de frottis nasaux prélevés sur des participants en Arizona.Toutefois, une fois que les autorités sanitaires ont commencé à confirmer les cas de COVID-19 en Arizona, l'équipe a décidé de passer ses recherches pour se concentrer sur le SRAS-CoV -2.Selon le Dr Efrem Lim, professeur adjoint à l'École des sciences de la vie de l'ASU et chef de l'équipe de recherche, «[t]ce fut l'occasion scientifique d'une vie pour l'ASU de pouvoir contribuer à comprendre comment ce virus se propage dans notre communauté. En tant qu'équipe, nous savions que nous pouvions faire une différence significative. »Après avoir retiré les écouvillons nasaux grippaux de leur étude, l'équipe avait 382 échantillons à gauche. Parmi ceux-ci, ils ont confirmé que cinq contenaient le SRAS-CoV-2. L'équipe a ensuite effectué un séquençage de nouvelle génération sur l'ARN des échantillons de SARS-CoV-2, ce qui leur a permis de déterminer rapidement les 30000 caractères du code génétique du virus. ces séquences de SARS-CoV-2 déposées dans la base de données EpiCoVTM à but non lucratif de GISAID, il est devenu clair que l'un des virus avait une mutation unique qui impliquait la suppression de 81 lettres de son génome. Pour le Dr Lim, "[o]L'une des raisons pour lesquelles cette mutation est intéressante est qu'elle reflète une grande suppression qui s'est produite lors de l'épidémie de SRAS de 2003. »Des recherches antérieures ont suggéré que des suppressions similaires réduisaient la capacité du coronavirus au cœur de l'épidémie de SRAS de 2003 à se répliquer. Un virus affaibli peut avoir un avantage sélectif réduit à court terme - mais il peut avoir un avantage sélectif accru à moyen et long terme.Les suppressions que l'équipe ASU a identifiées dans SARS-CoV-2 affectent des parties du code qui produisent un protéine. Les scientifiques pensent que cette protéine est essentielle pour aider le SRAS-CoV-2 à échapper aux défenses humaines, lui permettant de se répliquer rapidement. La mutation du virus peut être utile pour aider les scientifiques à mieux comprendre comment le SRAS-CoV-2 rend les gens malades. De même, cela peut aider au développement de médicaments antiviraux qui peuvent réduire la gravité de la maladie jusqu'à ce qu'un vaccin efficace apparaisse, mais les scientifiques doivent d'abord faire plus de recherches. L'équipe de l'ASU explore actuellement précisément l'effet de la mutation sur le fonctionnement du virus.Les chercheurs ont également rejoint le Translational Genomics Research Institute, l'Université d'Arizona et la Northern Arizona University pour créer l'Arizona COVID-19 Genomics. Union, qui a l'intention d'étudier plus avant les mutations du SRAS-CoV-2.Pour des mises à jour en direct sur les derniers développements concernant le nouveau coronavirus et COVID-19, cliquez ici.